- федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Томский государственный педагогический университет»
- федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Томский государственный архитектурно-строительный университет»
- Томский филиал государственного образовательного учреждения высшего профессионального образования Московский государственный гуманитарный университет имени М.А. Шолохова
- государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Сибирский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации
- федеральное государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования Томский военно-медицинский институт» Министерства обороны Российской Федерации»
- федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования «Национальный исследовательский Томский государственный университет»
- Томский институт негосударственного образовательного учреждения высшего профессионального образования Восточная экономико-юридическая гуманитарная академия» (филиал)»
- филиал федерального государственного образовательного учреждения высшего профессионального образования Сибирская академия государственной службы» в г. Томске»
- федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Томский государственный университет систем управления и радиоэлектроники»
- Томский филиал федерального казенного образовательного учреждения высшего профессионального образования «Кузбасский институт Федеральной службы исполнения наказаний»
- Томский филиал федерального государственного образовательного учреждения высшего профессионального образования Академия права и управления Федеральной службы исполнения наказаний»
- федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования «Национальный исследовательский Томский политехнический университет»
- Западно-Сибирский филиал в г. Томске Российского государственного университета инновационных технологий и предпринимательства
- Томский сельскохозяйственный институт — филиал федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего профессионального образования «Новосибирский государственный аграрный университет»
- Томский филиал федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего профессионального образования «Российская академия народного хозяйства и государственной службы при Президенте Российской Федерации»
- Западно-Сибирский филиал Федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего образования «Российский государственный университет правосудия» (г. Томск)
- Филиал федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего профессионального образования «Российский государственный социальный университет» в г. Томске
- Православная религиозная организация — учреждение высшего профессионального религиозного образования «Томская Православная Духовная Семинария» Томской епархии Русской Православной Церкви
- Автономная некоммерческая организация высшего профессионального образования «Томский заочный финансово-юридический институт» (АНО ВПО «ТЗФЮИ»)
- Негосударственное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Томский экономико-юридический институт» (НОУ ВПО «Томский экономико-юридический институт)
- Негосударственное (частное) образовательное учреждение высшего профессионального образования «Томский институт бизнеса» (НОУ ВПО «ТИБ»)
- Томский филиал негосударственного аккредитованного частного образовательного учреждения высшего профессионального образования Современной гуманитарной академии